Игумен Корнилий (Алексеев) родился в 1873 году в д. Барбаши, Псковской губерни. Пострижен в мантию с именем Корнилий в Спасо-Елизаровском монастыре.С 1919 по 1924 год был игуменом Спасо-Елеазаровой пустыни.
С 1924 по 1930 год был келейником и помощником архиепископа Варлаама (Ряшенцева), управлявшего Псковской епархией в 1923-1924 годах. Когда архиепископа Варлаама назначили управляющим Любимским викариатством Ярославской епархии, игумен Корнилий переехал вместе с ним на новое место служения и продолжал помогать ему, соучаствуя в его церковных делах. Арест игумена Корнилия был большим ударом для архиепископа Варлаама; он говорил, что с арестом игумена Корнилия вокруг него не осталось уже ни одного надежного человека.
Игумен Корнилий был арестован 31 января 1930 года по делу Ярославского «филиала» к/р монархической организации «Истинно-Православная Церковь». 2 марта 1930 года — осужден и приговорен к 3 годам ссылки в Севкрай. Дальнейшая судьба игумена Корнилия неизвестна.